前提として新たなサーバーが開かれるというのはエイプリルフールネタの可能性が高いです。ネタじゃなかったとしても分かりにくい時期に投稿してる…
質問に答えると、新しいサバができた場合ほぼ完全に独立します(闘技場など一部コンテンツはマッチングします)
メリットとしては、新サバで始めた全員が同条件で始めることになるので、戦闘力差が少ない状態で始められます。古参の高戦闘力に倒される機会が減るので、ゲームを楽しむ幅が広がりますね。あとは新サバ限定の成長特典バフが付いたりします。始めたばっかりなら新サバに移行する方が楽しいかもしれません(もちろん新サバができるのであればですがw)
あと、過去の事例として新サバ全体の戦闘力が上がってくれば現存するサバに統合されてきました。


追伸
ガチだった模様…
新サバのメリットはそのままなので参考程度にどうぞ (編集済み)