ワールド経営中も自動狩りは可能です。ただし、領地にいる時と、経営中は時間が一度リセットされるので、それぞれ3分経過を待たないと報酬は貰えないです。
　あと、不具合かどうかわかりませんが。経営を終了後、自分の場所が強制的に、経営を終了した村に移動されることがあります。その場合、3分経過しても報酬を貰えない可能性があります。
　昔、経営の待機時間が5分の時は、ついでに自動狩りさせていましたが、今は1分となりましたから、わざわざ3分間待って報酬を受け取るのは時間的に非効率かと思います。領地の自動狩りは闇精霊放置と効率一緒だし。